北京九龙山自然保护区位于北京市西郊，门头沟区东部。东临永定河，南与潭柘寺镇和永定镇接壤，西、北与王坪办事处和妙峰山镇相邻，中部为龙泉镇。地理坐标为东经115º59’～116º06’，北纬39º54’～39º57’；区域范围呈“<”形；保护区南北宽约6km，东西长约10km，总面积1333.4hm2。保护区管理处设在华林中心所在地泗涧沟，地处门头沟区城子街道办境内。